KaleidaGraph 日本語版は、システムのフォントを利用してインターフェースを表示しています。英語の Windows の環境ではシステムフォントが異なるため、インターフェースは文字化けします。
英語 OS に入力メソッドとして日本語が設定されていても状況は変わりません。これは製品の仕様となります。