GaussView は、Gaussian に渡す入力ファイルの作成を支援したり、Gaussian によって作成された出力結果をグラフィカルに分析できるよう開発されたグラフィカル・ユーザーインターフェースです。GaussView に Gaussian の計算モジュールが含まれているわけではありません。Gaussian の利用を手助けするためのフロントエンド/バックエンド・プロセッサとも言うべき存在です。Gaussian ユーザーが GaussView を使うメリットには主として次の３つがあげられます：

GaussView に搭載された先進の可視化機能を使用して、非常に巨大な分子でも素早く簡単に描画できます。描画された分子構造は、マウス操作だけで回転、移動、拡大させることが可能です。PDB をはじめとする標準的な分子ファイル形式のファイルをインポートすることができます。
GaussView を使うことで、Gaussian 計算の各種セットアップ作業が容易になります。普段よく使用するジョブタイプでも、ONIOM、STQN 遷移構造最適化 (Opt=QST2/QST3)、CASSCF 計算、周期的境界条件 (PBC)といった高度な手法を利用する場合にも、インプットデータの面倒な準備がたいへん簡単になります。GaussView と同一のマシンに Gaussian がインストールされていれば、GaussView から直接 Gaussian を起動し、計算を開始することができます。このときデフォルトで使用する計算内容をあらかじめ定義したり、複数の計算テンプレートをスキームとして別名で保存しておけば、ジョブのセットアップ作業を高速化できます。
Gaussian 計算の結果を GaussView の様々なグラフィック技術を駆使して詳しく調べることができます。グラフィカルに表示できる Gaussian の計算結果には以下のようなものがあります：
- 構造最適化された分子構造
- 各種分子軌道
- 計算された様々な密度の電子密度表面
- 静電ポテンシャル表面
- 磁気特性の表面
- 表面の等高線表示
- 原子の荷電と双極子モーメント
- 振動周波数に対応する基準モードのアニメーション
- IR、ラマン、NMR、VCD およびその他のスペクトル
- 分子の立体化学情報
- 構造最適化のアニメーション、IRC 反応経路追跡、ポテンシャルエネルギー面の走査、ADMP および BOMD 軌道。２変数の走査では、3D プロットとして表示可能。
- 上述の計算内容（構造最適化、IRC など）において得られる全エネルギー変化や各データのプロット

インストールや操作方法の支援サービス

ヒューリンクスでは Gaussian/GaussView のインストールや基本操作などのサポートサービス (有償) をご提供しております。
詳しくはこちらをご覧ください。

最適な計算環境の構築の支援サービス

ヒューリンクスでは、Gaussian/GaussView を実行するためのハードウェアも取り扱っております。
詳しくは弊社 (soft.sales@hulinks.co.jp) までお問い合わせください。

開発元：Gaussian, Inc.

機能一覧

GaussView 6 の 新機能は赤色 で、拡張された機能は青色 で示します。

分子構造の操作・調査

マウス操作、もしくは、的確な位置指定のためのポジショニングツールバーによる、3次元構造の回転・移動・拡大
構造パラメータの各種数値情報の表示
複数の分子を同期させたビュー (Synchronize) や同一構造の独立したビューの利用
複数分子を個別の操作や、集合体としての操作
ワイヤフレーム、チューブ、ボール＆スティック、空間充填 (CPK) といった分子の表示形式
元素記号、シリアル番号、NMR 遮蔽定数 (可能な場合) の各原子へのラベル表示
フォグ効果による奥行き表示
立体化学情報の表示
豊富な選択機能による原子のハイライト表示や表示・非表示の切り替え (オプションにより、ハイライト表示保持も可能)

分子構造の構築 / 修正

各種原子 (混成情報含む) 、官能基、リング構造、各種アミノ酸 (中心フラグメント、アミノ末端 (N末端) 、カルボニル末端 (C 末端) ) 、各種ヌクレオシド (中心フラグメント、 C3’末端、 C5’末端、遊離型 (free form) ) のための便利なパレット
カスタムフラグメントライブラリー
標準的な分子ファイルフォーマットの読み込み
- PDB形式 (AMBERで構築したPDB形式も含む) 。PDB ファイル読み込み時に、水分子の削除の選択や、標準的な残基の結合様式の適用のオプション。
- Gaussianインプットファイル (.gjfおよび.com) 、Gaussianアウトプットファイル (.log) 、チェックポイントファイル (.chk および .fchk) 、cube ファイル (.cub) 、frequency ファイル (.gfrq)
- Sybyl ファイル形式 (.mol2および .ml2) 。mol2ファイル読込み時に、ローンペア電子を含めるか変換するかのオプション。
- MDL ファイル形式 (.mol、.rxn および.sdf)
- Crystallographic Information ファイル形式 (.cif)
分子全体や選択残基または二次構造への、自動的もしくは手動による正確な水素付加
各種オプションの修正および保持を可能とする高度なオープン (Open) ダイアログ
- 中間構造の読込み
- chekcpointファイル読込み時に、formatted checkpointファイルの自動保存、Bond Table情報の利用、弱い結合の表示をするか否かの選択
- 複数ジョブを含むログファイルにおいて、読込む結果をコントロール
- 複数ジョブを含むインプットファイルにおいて、読込む結果をコントロール
- PDBファイル設定
- Sybyl Mol2 ファイル設定
結合タイプや距離、結合角、二面角の変更
高度なクリーン機能による合理的な構造
要求に応じた結合様式の再計算
特定の点群対称性の保持、指定したサブグループの対称性を落とすことが可能
構造の鏡像反転
選択した原子ついて構造の反転
選択した原子群の重心点への原子やフラグメントの追加
原子群のグループ名称の定義方法
- クリック選択、長方形選択、ブラシ選択モード (カスタマイズ可能)
- 原子タイプ、原子番号、MM設定、ONION レイヤーを組み合わせた複雑な選択
- PDB ファイルの残基や二次構造 (例えば、ヘリックス構造や鎖構造) による選択
- 結合または近接条件による選択拡張
- 表示する目的や Gaussian インプットファイルへのグループの利用
非標準的な同位体の指定
フラグメント配置動作のカスタマイズ
表示される結合タイプを決定する各種原子間の結合距離を指定

特定ジョブタイプの設定機能

マウスやスプレッドシートによる簡単な操作による複雑な計算のインプットを設定

ポリマー、2次元表面、結晶構造のユニットセル構築 (周期境界座標)
- 指定した空間対称性の保持
ONIOM レイヤー原子の割り当て方法
- 直接選択
- 指定原子に近接した結合
- 指定原子からの絶対距離
- PDB ファイルの残基、二次構造
- 複雑な選択基準
MM 計算用の原子タイプおよび電荷の表示および定義
redundant 内部座標の追加および再定義
構造最適化計算時の固定原子および固定座標の指定
QST2 および QST3 遷移状態構造最適化計算時における等価な原子の特定
CASSCF などに利用する軌道の選択、再配置や再占有といった MO の操作
Guess=Fragment 計算や Counterpoise 計算に利用するフラグメント定義
- フラグメント単位での電荷やスピン多重度の割り当て
インプットファイルの分子指定セクションへの PDB データの取り込み
振動計算に利用する基準振動モードの選択
NMR スピン-スピンカップリングの原子を指定
GMMXアドオンを用いた配座の探索
別売の AMPAC とのインターフェイスを介した統合
既存のチェックポイントファイルからデータを回収するジョブの設定
最新のGaussian 16 機能のサポート

Gaussian計算の準備と実行

簡単なメニュー形式のインターフェイスを利用したインプットファイルの作成
- 関連オプションの自動表示機能を含むポップアップメニューからのジョブタイプ、計算手法、基底関数の選択
- 全ての Gaussian 16 機能のサポート
- 頻繁に利用される一般的なオプション (例えば、SCF＝QC) への便利な設定
- 読み込んだファイルへの追加インプットセクションの保持
- Gaussian へのジョブ投入前にインプットファイルをプレビュー
Ampacインプットファイル、Gaussianインプットファイル、MDL Molファイル、MDL SDFファイル、GMMXインプットファイル、Sybyl Mol2ファイルといった異なるファイル形式へ変換
溶媒中の計算のための溶媒分子やその他のパラメータの選択
Link 0 コマンドの設定
- マルチプロセッサおよびクラスターやネットワーク並列計算の設定
- Link0ファイルに対する拡張されたコントロール
テンプレートからジョブ設定をするための計算スキーム (Calculation scheme) の利用
シングルクリックによる Gaussian ジョブの実行 (Quick launch)
インプットファイルの分子指定セクションの自動生成
- 任意で結合情報を付加情報セクションへ自動生成
ローカルマシンでの Gaussian やユーティリティのプロセスのモニタリングおよび制御
検索可能なテキストウィンドウ上でのログファイルの逐次表示
カスタマイズ可能なスクリプトによるリモート計算の起動
ジョブの生成 (特別な入力の自動化)
- ポリマーや結晶構造などの周期境界構造のための PBC 並進ベクトル
- 軌道の交換
- QST2 や QST3 による遷移状態探索のための複数の分子指定セクション
- Guess=Fragment や Counterpoise におけるフラグメントごとの電荷およびスピン多重度
ワンステップで複数のジョブファイルを設定
追加の操作なしに、ジョブのリストを実行するための統合されたキューイングツール

Gaussian 計算結果の表示

計算結果概要の表示。予測された熱力学的物理量を表示する Thermo タブ、最適化ステップ情報を表示する Optタブの追加。
開いている分子の情報を表形式で表示 (編集可能) 。計算結果の表を作成するために利用可能。
原子電荷の確認 (数値表示、色分けによる原子電荷表示) 、双極子モーメントのベクトル表示
Gaussian計算による原子プロパティ、結合長、結合次数の可視化
複数ジョブのGaussianインプットやアウトプットファイルから一部またはすべての結果を開く
分子軌道、電子密度、静電ポテンシャル、スピン電子密度、NMR遮蔽電子密度などの表面および等高線図の作成
- ソリッド、半透明、ワイヤーメッシュの3次元表示形式と、2次元の等高線
- 各物性による表面の色付け
- 目的の等高面の指定
- Gaussian により生成された cubeファイルの読み込み
- 再利用のための計算済み cube ファイルの保存
- cubeファイルの操作 (例えば、差電子密度を求めるための引き算)
SCRF計算で用いた溶媒中の空孔 (cavity) を表示
分子数によらずあるグループにおける ORD (Optical Rotary Displacement) 計算の結果をプロット
振動数と関連する基準振動モードのアニメーション
- 変位ベクトル、双極子導関数の単位ベクトルの表示
- 基準振動モードに沿って特定の距離に構造を移動
- 一部の振動モードを選択して表示
- 作成した基準振動モードのチェックポイントファイルへの保存
- 振動解析や基準振動モードにおける同位体置換
- 振動数を任意の値でスケール
- 繰り返し、フレーム切り替えの時間、繰り返しにつき表示されるフレーム指定のオプション
赤外 (IR) 吸収スペクトル、ラマン (Raman) 分光スペクトル、 NMRスペクトル、振動円二色性 (VCD) スペクトル、ラマン光学活性 (ROA) スペクトル、紫外可視 (UV-Visible) 吸収スペクトル、 調和および非調和振動スペクトル などのスペクトル表示
振動数に依存する計算における入射光の周波数の指定
NMR 計算結果
- NMR 化学シフトの絶対値表示、もしくは、参照化合物に対する相対値表示
- NMR 計算結果をテキストとして出力
構造最適化、IRC 反応経路、ポテンシャルエネルギー表面の探索、BOMD および ADMP 計算のトラジェクトリーについて一連の構造をアニメーション表示
- 一度の再生もしくはループ再生
- 逆再生
- 関連データのプロットの作成
2変数のスキャン計算結果の 3次元表面プロット表示
プロットやスペクトルのカスタマイズ
- ズーミング、スケーリング、反転など
- プロットへの分子物性の追加
- 線や棒の特性の指定、線形結合した線のプロットやその形状の指定、データの構成成分に重みの割り当て (Boltzmann分布による平均化) を行うためのミクスチャーエディタ (Mixture Editor)
- 線の色、キャンバスや背景の色、タイトル、xおよびy軸設定などといった高度なプロット可視化のカスタマイズ
カスタマイズしたものも含む、全てのイメージ画像のファイルへの保存
- JPEG や PNG形式などの Web グラフィックスの作成
- TIFF、JPEG、ベクトル画像である EPS形式などの出版物品質のグラフィックファイルやプリントアウトの作成
- 任意の大きさや解像度での画像生成
- フルカラー、もしくは高品質なグレースケール形式の選択
- カスタムカラーや背景の指定
プロットをイメージやテキストデータとして保存
GIF、MNG、MPEG4 形式でのアニメーションの保存や各フレームでの保存
動画のフレームの配列や時間のコントロール機能の拡張

GaussView のカスタマイズ

GaussView 機能の大部分のプレファレンス設定/保存

個別にツールバーの構成をコントロール
元素別の色や分子ウィンドウの背景色、表面や透過性の色
原子やフラグメントの結合、必要に応じて水素の付加、自動的にすべてまたは一部にクリーン機能の実行、などの分子構築操作
Gaussian 16 計算の設定
Gaussian ジョブの実行方法
表示モード
ウィンドウの配置や表示・非表示の切り替え
アイコンの大きさ
ファイルやディレクトリ (フォルダ) の場所
画像のキャプチャや印刷のデフォルト
アニメーションの設定や動画のデフォルト
クリーン機能の変数
電荷分布の表示のデフォルト
任意の結合パラメータのデフォルト
GaussView のヒント
Windows OS でファイル拡張子の関連付け
独立のダイアログに統合されたヘルプファイル

動作環境

GaussView は全てのバージョンでプログラムに約300MB のディスク容量が必要となります。メモリ (RAM) の容量はいずれのバージョンでも 1GB 以上が推奨されます。動作保証の OS は、基本的にGaussian 16 と一致します。

GaussView 6 (および GMMX)

X86_64 ベースの Linux
Intel IA32 ベースの Linux
64-bit MacOSX
32-bit Windows
64-bit Windows

※上記各環境に対応する製品名は個々に異なります。(例：GaussViewW6)
※最新情報は開発元ページをご確認ください。

ライセンス

GaussView には、UNIX/Linux 版、Windows 版、Mac OS X 版がございます。
OS別のライセンスの詳細は下記をご覧ください。

ライセンスの詳細

Same Machine と Different Machine

GaussView 6 を Gaussian 16 と同一のマシン上で使用する場合は Same Machine を、Gaussian 16 とは異なるマシン上で GaussView 6 を使用する場合は Different Machine をお求めください。Different Machine 版には、Gaussian ユーティリティが付属します。詳細は下記をご覧ください。

GaussView6 (G16 on Different Machine)
異なるマシンへの GV6 導入と一般的な使用例について

年間メンテナンス/有償サポートサービス

Annual Maintenance （年間メンテナンス）
Gaussian 社では、製品毎に Annual Maintenance (年間メンテナンス) プログラムが用意されています（原則としてサイトライセンスにご加入されているお客様が対象となります。）。メンテナンスにご加入されると、Gaussian 社のスタッフによるテクニカルサポート（英語）を受けることができます。また、メンテナンス期間内にマイナーリビジョンおよびメジャーバージョンのアップグレードがあると、 Gaussian 社からメディアが無償で送付されます。詳しくは、Gaussian, Inc. Maintenance Program または、弊社営業部 (soft.sales@hulinks.co.jp) までお問い合わせください。
ヒューリンクス有償サポートサービス
※ヒューリンクスでは独自の有償サポートサービスを提供しています。詳しくはこちらをご覧ください。

マイナーリビジョンのアップグレードについて

Gaussian 年間メンテナンスにご加入されているユーザー様には、Gaussian 社からマイナーリビジョンのメディアが無償で送付されます。
メンテナンスにご加入されていないユーザー様がマイナーリビジョンのアップグレードをご希望される場合は、マイナーリビジョンのメディアをご購入していただく必要があります (Minor revision media fee) 。詳しくは、弊社営業部 (soft.sales@hulinks.co.jp) までお問い合わせください。

製品価格

※ 価格は、お見積りフォームからお問い合わせください。
製品名は ”ライセンスの詳細 ” でご案内しております。ご希望の OS よりご選定ください。

製品の発送について

製品は Gaussian 社からエンドユーザー様に直送されます。ご購入確認書等でエンドユーザー様情報（日本語・英語）をお知らせ願います。

シングルマシン版の注意事項

既にサイトライセンスをお持ちの場合

既にサイトライセンスをお持ちの場合は、シングルマシン版を購入しなくても GaussViewW をご使用いただけます。
シングルマシン版ご注文後にサイトライセンスをお持ちであることが分かった場合には、次の中からお客様のご希望を確認させていただいた上で手配を進めます。
1. サイトライセンスは使用せず、シングルマシン版を購入する。（CD、マニュアルが付きます。）
2. サイトライセンスの管理者からメディアを借りてサイトライセンスを使用する。（ご購入いただくものはございませんので、ご注文はキャンセルさせていただきます。）
3. サイトライセンスを使用するが、最新のメディアを購入する。（ご注文内容を、Minor Revision Media Fee にご変更いただきます。）
  ※ なお、サイトライセンスの範囲内でメディアをご購入されたお客様には、弊社の無償テクニカルサポートサービスはご提供いたしかねます。ご了承ください。

お申込みについて

ご所属の組織（企業・大学・研究所など）経由でのご注文が基本となります。（個人でのご注文は原則お請けできません。）

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サポート

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