ChemFinder
化学情報データベース管理システム
ChemFinder は、化学情報を扱うすべての人のためのデータベース管理システムです。ユーザー定義可能なフォームを使って化学構造式や数値データ、テキストデータを作成、閲覧、検索、そして更新することができます。また、サブフォーム内に関連データをリンクさせることも可能です。
物性値の計算、各種モードによる化学構造式の表示や編集、インポートされたデータを元にしたデータベースやフォームの自動生成、データの書き出しや印刷等も実行でき、保存したクエリを簡単に管理したり、お気に入りのデータベースを設定したり、Explorerウィンドウからデータベースの階層構造を表示することもできます。
その他、R-基分析の実行、画像ファイルの読み込み、Python を使用したプログラミング機能も装備されています。
| ChemDraw Prime | ChemDraw Professional | Signals ChemDraw | |
|---|---|---|---|
| 使用可能なアプリケーション (※ Windows版のみ) | – | ChemFinder Std | ChemFinder Ultra |
| データベースの検索 | ■ | ■ | |
| 自動フォーム生成とタブ機能 | ■ | ■ | |
| リレーショナルデータベースとの連携 | ■ | ■ | |
| CALコマンドを用いたプログラミング | ■ | ■ | |
| BioViz | ■ | ||
| 特殊な構造式の検索 | ■ | ||
| 検索クエリの管理 | ■ | ||
| 化学的物性値の計算 | ■ | ||
| Python を用いたプログラミング | ■ |
ChemFinder Std 以上の共通機能
■ データベースの検索
化学構造式 (標準検索：Normal、完全一致検索：Exact、類似性検索：Similarity)、数値、テキスト、分子式、反応式、日付等の検索ができます。また、構造式検索では、互変異性体や代替基 (Alternative groups) の検索もサポートしています。
検索でヒットしたレコードには3つの表示方法があり、簡単に切り替えることができます。
■ 自動フォーム生成とタブ機能
構造式を含むファイル、データベース、SDFile、その他のソースから構造式をインポートし、データベースの構築や拡張を自動的に行います。
また、タブを作成して項目別にフォームを分割することで、情報が分かりやすくなります。
■ リレーショナルデータベースとの連携
サブフォームを利用することで、リレーショナルデータベース内の複数のデータテーブルを表示できます。
■ CALコマンドを用いたプログラミング
CAL (ChemFinder Automation Language) は、ChemFinder のさまざまな操作を制御するプログラミング言語です。ChemFinder上における操作の自動化/カスタマイズが可能です。
ChemFinder Ultra の機能
■ BioViz
BioViz は、ChemFinder内の数値データをグラフ化する可視化アドインです。他のアプリケーションを使用せずとも、データの傾向や相関関係を確認できます。表示可能なグラフ数に制限はなく、グラフ毎に異なる方法でデータを可視化できます。
- クラスタリング/クラスター解析
単一のフィールド (化学特性値など)に対して、クラスタリングを実行できます。また、プロファイルウィザードを利用して、複数のフィールドに対してクラスタリングを行うことも可能です。
- プロット (折れ線グラフ、散布図、ヒストグラム) の作成/編集
データベース全体や、クエリの結果をさまざまなプロットに起こすことができます。そして、プロットのポイントにマウスを合わせることで、当該の化学構造式や、その詳細情報も確認できます。また、プロットにフィルターをかけて、指定したデータセットの範囲を制限することもできます。
表示したポイントの形状や色を変更したり、凡例 (テキストボックス) を追加することも可能です。軸ラベルや背景色等も変更可能です。
- 統計分析
XとYの両変数に対して、最小値、最大値、平均値、中央値、および標準偏差を計算できます。また、カーブフィッティングを選択した場合、決定係数 (R2) の利用も可能です。
■ 特殊な構造式の検索
Find Structureサブメニューを使用することで、特殊な構造式の検索設定を行うことができます。
また、受容体とリガンドなど、原子と結合間の特定の3D関係性を検索する場合に、幾何学的構造 (線や面など) や制限 (範囲指定など) の3D属性をクエリに追加することも可能です。
■ 検索クエリの管理
Explorerウィンドウのクエリツリーコントロールにて、検索クエリのリストを管理できます。クエリリストから、検索履歴を遡って同じクエリを実行することも、クエリの名前を変更することも、あるいはクエリを削除することも可能です。
クエリは個別に *.cfq ファイルとして保存することも、フォームと同時に保存することもでき、保存したクエリを再利用することも可能です。
クエリリストは、ドラッグ＆ドロップで簡単にクエリ同士を統合できます。
■ 化学的物性値の計算
ChemFinder では、さまざまな化学的物性値の計算が可能です。物性値が入るフィールドを簡単に自動で作成することができ、レコード毎に計算されます。
■ Python を用いたプログラミング
ChemFinder には、Pythonインタープリターが組み込まれています。Office製品で VB を使用して複雑なマクロを開発するように、Python を利用してスクリプトを開発することができます。
また、Pythonプログラムの開発は対話的に行うことが可能で、プログラムを1行ずつ実行することができるため、開発とデバッグが容易になります。
