新規購入お見積

データの可視化

StarDrop は、さまざまな可視化様式を迅速に適用することが可能です。複数のグラフを同時に見ることができ、元データとそれぞれのグラフ表示がインタラクティブにリンクし、複数のプロパティと化合物の構造間の関係を調査することができます。

 

グラフとダッシュボード

StarDrop の可視化機能は、さまざまなグラフを表示することができます:

  • ヒストグラム
  • 2D / 3D 散布図
  • 円グラフ
  • 箱ひげ図
  • SAR およびカテゴリプロット
  • レーダーチャート
  • ヒートマップ
  • 折れ線グラフ、複数折れ線グラフ
  • ROC カーブ

複数のデータセットとシリーズを同じ図表に含めることができます。プロパティは、色、点の大きさ、シンボル、境界線、透明度などで表現することができます。図表は、化合物、プロパティ、データセット間の関係を浮かび上がらせるために、格子状に分割表示することができます。

StarDrop では、重要な関係性を特定するために図表を拡大、移動、回転することができます。興味のある化合物をインタラクティブに選択したり、複数のプロパティで図表内のデータをフィルタリングすることにより、データの更なる調査も可能です。また、興味のある化合物にコメントやラベルを付けたり、異なるフォントを使って図表をカスタマイズすることができ、コピー&ペーストするだけでレポートや論文に利用することができます。

「ダッシュボード」機能を使うと、調整可能な Project 形式画面に複数のインタラクティブな図表を組み合わせて表示することができるため、チームメンバーがプロジェクトの進行を一目で把握することができます。

Video collection: charts and dashboard

 

ケミカルスペース

StarDrop のユニークな 2D / 3D ケミカルスペースは、プロジェクト内の化合物に対するプロパティやスコアの分散を簡単に探索し、異なる化合物選択戦略の影響を考慮することを可能にします。

  • 複数のデータセット
    異なるケミカルシリーズと数千のデータポイントを比較
  • 柔軟さ
    構造やプロパティに基づいたケミカルスペース投影を作成
  • 使いやすい可視化
    高品質な化合物のホットスポットを特定し、素早く選択肢を絞るために、プロット内の点の色、シンボル、大きさ、境界線、透明度をプロパティやスコアに応じて設定
  • 選択
    異なる化合物にリスクを分散し、プロパティのバランスが良い化合物のセットを、素早く簡単に選択可能
  • 詳細を表示
    対応する点にマウスオーバーすると化合物の構造を見ることができ、クリックすると詳細が表示され、さらなる分析が可能

Quick tip video: Compound prioritisation and selection

 

豊富な情報を持つ SAR プロット

StarDrop では、豊富な情報を持つ構造活性相関 (SAR) プロットを作成することができ、 R グループ、フラグメント、リンカーの変化がケミカルシリーズ内の化合物のプロパティに与える影響を可視化することができます。

StarDrop の可視化機能は、SAR プロット内の各セル内に次のような様々な図表形式を表示することができます:

  • ヒートマップ
  • レーダープロット
  • 2D 散布図
  • 円グラフ

追加のプロパティは、色や大きさで表現することができ、図表は化合物、プロパティ、データセット間で比較できるように格子状に分割表示することができます。

Quick tip video: Information rich SAR

 

クラスタリング

例えば、多様な化合物のデータセット内の化学系列を特定したり、ハイスループットスクリーニングの結果をトリアージするためにヒットに関する SAR を分析したり、良好な特性やスコアをもたらす可能性のある化学の「領域」を特定したりするために、「類似した」化合物のグループをクラスター化します。

StarDrop には、クラスターを定義するための 3 つの異なるアプローチが用意されています。

  • 共通下部構造の最大数
  • 化合物の類似性
  • プロパティ

Quick tip video: Clustering in StarDrop