バージョン 9 で追加された機能

Base (塩基) ビュー

CodonCode Aligner 9 には、機能と制限酵素切断部位を表示する新しい Base (塩基) ビューが導入されています。

feature (特徴) をクリックすると、features とそれがカバーする塩基が選択されます。 Shift キーを押しながらクリックすると、選択範囲が広がります。最初に制限酵素名をクリックし、2 番目の酵素名を Shift キーを押しながらクリックして、制限断片を選択できます。

マウスオーバーすると、feature と切断部位に関する情報が表示されます。上部のミニマップは feature の概要を示し、シーケンス内のクイックナビゲーションを可能にします。

Base ビューの左側にあるツールバーボタンには、特定の feature と酵素の表示非表示、または選択するオプションが含まれます。たとえば、一度切断した酵素のみを表示します。

Aligner 9.0 では、長さ、名前、シーケンス、方向、およびアセンブリ状態に基づいてサンプルとコンティグを選択する機能が追加されています。

この機能は大きなプロジェクトで作業する場合に特に役立ち、スクロールしてシーケンスを選択する必要がなくなります。

Search in the current selection オプションを使用して、これらの選択方法を一度に複数使用できます。

Aligner 9.0 に Genbank と EMBL 形式のシーケンスエクスポート機能が新しく追加されました。

また、すべての Genbank および EMBL feature を Aligner 9 にインポートして、ユーザー設定に基づいて表示できます。 Feature の色は設定可能で、塩基のナビゲートおよび選択するために使用できます。

CodonCode Aligner 9.0 は、Windows 10 と macOS 10.14 (Mojave) に対応しています。