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ユーザビリティ

エレガント、ユーザーフレンドリー、インタラクティブ

  • 64-bit ネイティブ Mac & Windows アプリケーション
  • Apple Silicon と Intel に最適化
  • macOS Sonoma と Windows 11 をサポート
  • エレガントなユーザーインターフェイス:すっきりとしてパワフル
  • ドラッグ&ドロップによる高速データインポート
  • 複数回の取り消し/やり直し
  • マルチドキュメントの同期
  • 触覚フィードバック (Mac):原子や結合を感じることができます。

ビジュアライゼーション

ピクセルパーフェクトな 3D グラフィックス

  • ゴージャスな高 DPI “Retina”グラフィックス
  • デプスフェーディング、デプスズーム/プロファイリング
  • ステレオペアプロット
  • 画面外の赤/青ステレオ (カラー)
  • 自動パースペクティブ

分子の構築

ポイント&クリックで最適化

  • 原子の複製、切り離し、移動、編集
  • H 原子の自動追加
  • ジオメトリの最適化 (エネルギーの最小化)
  • エネルギーの計算
  • 振動モードと IR スペクトルのシミュレーション

結晶構築

複雑な構造を簡単に構築

  • 対称ブラウザを備えたクリスタルエディタ
  • 混合 / 無秩序サイト占有をサポート
  • 原子変位パラメータ (Uiso, Uij)
  • 動的なプロット範囲制御:各軸に沿って分数座標で任意の範囲をリアルタイムに更新
  • 自動範囲最適化でセル端の陽イオン配位を修復

分子結晶ツール

結晶中の分子を見つける

  • 非対称単位を表示
  • 分子単位を表示
  • 無傷の分子を含むセルの内容をすべて表示
  • 分子フラグメントの非表示化 / 修復
  • 個々の分子を選択 / 分離

原子と楕円体

色、サイズ、スタイルのカスタマイズ

  • サイトまたは元素ごとに色とサイズを自動設定
  • 編集可能な元素の色と半径のプリセット
  • ユーザー定義の熱振動楕円体の確率値
  • 楕円体ではなく小さい球として表示するオプション (H 原子など)
  • 素、サイトラベル、原子番号によるラベル付け

原子ベクトル

強誘電体 / 磁気双極子を表示

  • 選択した原子に追加
  • 方向、スタイル、色のライブ編集
  • ベクトルフィールドをテキストデータからインポート

結合

カスタムボンドの高速検索と表示

  • Bonds Inspector:個々の結合仕様をインタラクティブに編集可能
  • 元素ペアの距離ヒストグラム
  • 一次結合および二次結合
  • 結合スタイル:ダブル、トリプル、破線、点線、ストライプ
  • シリンダーオプション:太さの選択
  • 結合半径のカスタマイズ
  • 結合距離ラベルオプション

多面体

複雑な構造を簡素化

  • 結合検索で自動生成
  • 巨大なゼオライトケージ、MOF などを可視化
  • スタイル:ソリッド、半透明、ハイブリッド、ブランク
  • 頂点に熱振動楕円体または原子球を表示
  • 凹面多面体 (曲面) の可視化

格子面

対称性、サーフェス、スラブを探る

  • 複数の平面/平行平面のセットを表示
  • 対称性に関連した平面を生成
  • 構造内を移動; 切片にスナップ
  • 構造をスライス; スラブを定義

サーフェイスオーバーレイ

分子形状と空洞

  • スペースフィル、ファンデルワールス、溶媒排除
  • リアルタイムプローブ球半径コントロール
  • ユーザー定義の色と不透明度

ボリューメトリックデータ

構造と特性を可視化

  • 複数の 3D データセットをインポートして視覚化
  • データセットの追加 / 減算
  • 等値面 / ボリューム、ポイントクラウド、スライス
  • リアルタイムの範囲スライダーコントロール (プリセット付き)

オーバーレイ

テキスト、線、矢印でラベル

  • 線、矢印、リッチテキストボックスを追加
  • カスタマイズ可能な軸ベクトル表
  • 結合ラベル (距離)
  • 凡例、ルーラー / スケールバー

回転と拡大縮小

リアルタイムなマウス / トラックパッド制御

  • マルチタッチジェスチャーによる回転と拡大縮小
  • Leap Motion® ハンドジェスチャーコントロール (Win)
  • AI 搭載ハンドトラッキング (Mac)
  • タッチバーコントロール (MacBook Pro)
  • Rotator ポップオーバーによる正確な角度入力
  • 任意の格子ベクトル、平面法線に沿って表示

アニメーション

構造の挙動とダイナミクス

  • 複数の構造シーケンスを同期
  • 構造挙動の可視化
  • 大規模シミュレーションの軌跡を可視化
  • アニメーション中の回転とズーム
  • スクラバーコントロール:早送り / 巻き戻し

選択ツール

原子レベルでの編集

  • ツール:矢印 / 長方形、なげなわ、多角形
  • 選択範囲を反復的に選択範囲を拡大
  • 選択範囲を隣接原子、環、分子に拡張
  • 対称性関連原子や結合を選択
  • 選択範囲の非表示 / 分離
  • 元素、サイト、分子ごとに原子を表示

直接測定

原子、距離、角度を測定

  • 選択した原子が配位サマリーを表示
  • 原子間距離 (誤差伝播あり)
  • 投影距離 (スクリーン平面内)
  • スクリーン平面内の任意の角度
  • 任意の 3 つの原子間の角度 (ロールオーバーあり)
  • 任意の 4 つの原子間のねじれ角

計算

構造特性を調べる

  • 細孔 (Porosity)
  • 3D 細孔マップ
  • 距離マップ
  • 分子体積
  • 表面積 / 体積計算
  • 電子密度マップ
  • 重心
  • 分子中心
  • キャビティファインダー (半透明の中心を追加)
  • 選択した原子を通る環
  • 原子間距離
  • 原子密度 / 距離ヒストグラム
  • ペア分布関数:X 線、中性子
  • 多面体歪み指数
  • 平面パッキング係数
  • 平面間 / ベクトル角
  • D スペース計算
  • 選択した原子を通るるベストフィット線 / 面
  • 選択した原子から平面までの距離
  • 単位セルの体積、密度、化学式
  • フレームワークの自動化:表示の定型化

変換

格子を再定義する

  • 単位セル変換 + 原点シフト
  • スーパーセルの生成および崩壊
  • 無秩序なサイトの可視化 (スーパーセル内)
  • サイトをマージ:別々の構造をマージ
  • 構造の補間 (より滑らかなアニメーション)
  • 格子を曲げる:ナノシリンダー、スパイラル、ヘリックス
  • 結晶↔分子の変換

結晶工学

新しい構造を設計する

  • スラブとサーフェスの生成
  • 結晶格子に空間のブロックを挿入
  • ある構造を別の構造の中に配置
  • 界面 / ドメイン境界の可視化
  • 原子の挿入:エレメントタイプの変更
  • 結晶内で選択した原子を移動/回転
  • 球状ナノ結晶

結晶エネルギーモデリング

スーパーコンピュータは不要!

  • デスクトップ上で結晶構造を緩和
  • 任意の表面や構造ブロックを緩和
  • 高速モンテカルロ緩和と最小二乗法による精密化
  • 統合されたポテンシャルライブラリ
  • スマートなポテンシャル選択
  • モンテカルロ圧力 / 温度シミュレーション (定数 NPT または NVT)
  • 温度シミュレーションオプション

格子ダイナミクス

フォノンをインタラクティブに可視化

  • 完全なフォノン計算
  • 状態密度
  • 任意の点間の分散曲線
  • 振動モードの可視化、回転、スケール

熱力学的特性

エネルギーモデリングから計算

  • エントロピー
  • 熱容量
  • ヘルムホルツ自由エネルギー
  • ゼロ点エネルギー
  • 振動エネルギー

物理的特性

エネルギーモデリングから計算

  • 弾性定数
  • 体積弾性率、せん断弾性率
  • ヤング率
  • ポアソン比
  • 音速
  • 誘電率

出力

グラフィックス、ビデオ、データのエクスポート

  • 透明度のある高解像度のグラフィック
  • ビデオ:回転、アニメーション、振動
  • 3D プリント (STL 経由) + COLLADA 3D
  • 構造、座標、結合、距離
  • CrystalDiffract® および SingleCrystal™ (別売) と連携し、構造 / 回折の回転と再計算をライブで実行。原子レベルでリアルタイムに構造を編集し、回折パターンが更新されるのを確認可能

ファイルフォーマット

包括的なインポートとエクスポート

Format Import Export
  1. 3ED  
  2. ATOMS  
  3. CASTEP Cell  
  4. CASTEP Output  
  5. CASTEP Volumetric
  6. CCL  
  7. Chem3D Cartesian
  8. CIF a
  9. CMDF  
 10. CMDX
 11. CMMF  
 12. CMTX
 13. CSSR  
 14. Gaussian CUBE  
 15. DEN (Volumetric)  
 16. DL_POLY Config  
 17. DL_POLY Revcon  
 18. DL_POLY History  
 19. DMol3 “.car”
 20. DMol3 “.arc”  
 21. FDAT (CSD)  
 22. GRD (Volumetric)
 23. GROMACS  
 24. GSAS  
 25. GULP  
 26. ICSD  
 27. LAMMPS  
 28. Molfile  
 29. PDB
 30. Prismatic  
 31. RMCProfile
 32. SDfile  
 33. SHELX b  
 34. STRUPLO  
 35. SYSTRE c  
 36. TOPAS  
 37. VASP Structure  
 38. VASP Trajectory  
 39. VASP Volumetric  
 40. VESTA  
 41. Voxel
 42. WIEN2k
 43. XCrySDen Structure  
 44. XCrySDen Animation  
 45. XYZ
インポートに関する注意事項
a. CIF: 1 つの CIF ファイルから複数の構造体をインポートします (熱パラメータとエラーパラメータを含む)。
b. SHELX: マルチパートの SHELX ファイルをサポートします。複合構造または無秩序モデルの個々の状態を表示するオプションがあります。
c. SYSTRE: 対称性に関連した結合を自動カラーコーディネート表示します。

その他のデータフォーマット

Format Import Export
  1. Elements
  2. Coordinates  
  3. Visible Coordination  
  4. Crystal Coordination  
  5. HTML Structure  
  6. Distances & Angles  
  7. Vibrations List  

構造ライブラリ

CrystalViewer

  • 1400 の参照構造を瞬時に表示
  • 主な造岩鉱物 (400+)
  • ゼオライト骨格 (230)
  • 構造アーキテクチャ (アニメーション)
  • 基本構造タイプ
  • テーマ別ライブラリ

サポートサポートオプション

CrystalMaker 社が提供するサポート

  • 30 年以上の実績あるサービスとサポート
  • ユーザーガイド (PDF)
  • クイックスタートチュートリアル (PD)
  • ビデオチュートリアル + YouTube™ チャンネル
  • 無料テクニカルサポート
  • 定期的なアップデート