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StarDrop (スタードロップ)
インテグレーション

 

エンタープライズ・プラットフォームとしての StarDrp の包括的なデータ分析、可視化、分子設計環境は、他のインフォマティクスインフラストラクチャとシームレスにインテグレーションすることができます。ここでは、そのいくつかを例示します。

StarDrop を使って社内データにアクセス

StarDrop は、プロジェクトデータを素早く、簡単に取り出すことができるように、データベースとシームレスにインテグレーションすることができます。すでにこれらを行っているお客様の例は、次のようになります:

  • StarDrop のクエリ・インターフェイスを使って自社のデータにアクセス
  • レポートを生成する Oracle データベースにクエリを直接送信
  • 整形されたクエリを使った Web サービス
  • CDD Vault のようなクラウドベースのデータベースに接続
  • BIOVIA Pipeline Pilot、Certara D360、The Edge BioRails のようなサードパーティのミドルウェアと連携
  • StarDrop のリフレッシュ機能を使って、最新のデータで StarDrop 内の分析を即座に更新

3D ドッキングとアラインメント・モデルにシームレスにリンク

StarDrop は、専門家のための 3D ドッキングとアラインメント・モデルとリンクし、データの可視化、2D SAR 分析、予測モデルを1つの環境で処理することができます。これにより、次のことが可能になります:

  • StarDrop の Pose Generation インターフェイスを使って 3D ドッキングとアラインメント・モデルにアクセス
  • リアルタイムに 3D で設計を複数回繰り返して評価
  • 主要な計算化学ソフトウェアと連携。例えば、BioSolveIT FlexX、CCDC Gold、Chemical Computing Group MOE、OpenEye Scientific POSIT

自社のモデル、スクリプト、プロトコルを StarDrop と直接連携

StarDrop の機能を補完する他のインフォマティクス・プラットフォームと連携します。例えば:

  • 社内またはサードパーティのモデルを使って予測
  • BIOVIA Pipeline Pilot のようなプラットフォームでカスタムのスクリプトやプロトコルを実行
  • 分析や可視化のために読み込んだデータを使って、他のプラットフォームから StarDrop を起動
  • 社内の分析結果を Card View で表示

商用サプライヤーやパブリックなデータベースに接続

StarDrop は、サードパーティのデータベースと統合することができ、自社の SAR の理解を助け、ビルディング・ブロックを選択することで、商用で入手できるスクリーニング化合物を素早く検索できます。また、パブリックなデータベースから生物学的結果をシームレスに取り出す子ができます。無料でダウンロードできる拡張機能には次のようなものがあります:

  • eMolecules や MolPort から、商用のスクリーニング化合物やビルディング・ブロックを検索
  • ChEMBL、Protein Data Bank、PubChem 内の生物学的データを検索

他のプラットフォームから StarDrop に連携

StarDrop の多くの機能は、Web サービス経由で自社のインフォマティクス・プラットフォームからアクセスすることができます。例えば:

  • StarDrop のモデルを使った予測
  • Auto-Modeller モジュールを使ったカスタムモデルの構築
  • プロパティ・プロファイルに対する確率的なスコアリングを計算