生存分析・Kaplan-Meier 法の操作方法

SYSTAT 13 の例題「Melnmadm」データを利用します。このデータの内容は次のとおりです。

サンプルデータ：

MELANMDM：Wilkinson and Engelman (1996)。黒色腫 69人の患者データ。

変数	内容	タイプ
TIME	患者の生存日数	Numeric (連続変数)
CENSOR	打ち切り変数	Numeric (連続変数)
WEIGHT	重み付け変数	Numeric (連続変数)
ULCER	潰瘍の有無	Numeric (連続変数)
DEPTH	潰瘍の深さ	Numeric (連続変数)
NODES	転移したリンパ節の数	Numeric (連続変数)
SEX$	患者の性別	String (名義変数)
SEX	解析用にコード化した層化変数	Numeric (連続変数)

データの読み込み

ツールバーから File (ファイル) → Open (開く) → Data (データ) を選択して Data フォルダーから Melnmadm.syz を選択してデータをよび出します。

もしくはコマンドスペースで次の USE コマンドを入力して、Enter キーを押します。
use melnmadm.syz

解析の実行

SYSTAT で生存分析をするために必要な情報は、Time (時間)、Censor Status (打ち切り変数)、Strata (層別変数) です。(TIME、CENSOR、SEX$ です。)

ここでは、性別間による生存予後について検討します。充分なデータ数がないためノンパラメトリックの Kaplan-Meier 法を採用し、累積生存率を計算させ生存曲線を表示します。性別間の有意差検定は、Mantel-Cox、Breslow-Gehan-Willcoxon、Tarone-Ware の計算結果で確認します。

ツールバーから Advanced (アドバンス) → Survival Analysis (生存分析) → Nonparametric (ノンパラメトリック) を選択します。
ダイアログボックスで、次のとおり変数を指定します。

性別 (SEX$) 変数は、Male と Female で構成された名義変数のデータです。名義変数には、変数名最後に「$」記号が追加されることに注意して下さい。
Tables and Graphs タブは、デフォルトの設定が以下のようになっています。ここではこのまま使用しましょう。
OK ボタンをクリックすると計算を開始します。
アウトプットペインに計算結果が表示されます。
Survival Analysis:Life Table では、K-M Probability (累積生存率)、Standard Error (累積発生率)、95% 信頼区間等を示す生命表及び Mean Survival Time (平均生存時間)、Survival Quantiles (生存変位値) が各々のグループについて表示されます。