4.1.1.1 pH Rate Profile (pH 速度プロフィール)

pH 速度プロフィール (pH Rate Profile) 研究は、酵素の安定性と活性に対する pH の影響を観察するものです。酵素の活性部位には、ほとんどの場合、イオン化できる解離基 (ionizable groups) が含まれています。活性部位の立体構造 (コンフォメーション)、基質結合、または、反応の触媒を促進するには、これらの解離基がそれにふさわしいイオン形でなければなりません。pH を変化させることにより活性部位の立体構造 (コンフォメーション) に影響を与えることができます。

pH は、酵素で触媒される反応の速度に影響を与えます。

注意

• pH による 1/[S] および V_max の傾きの変化を測定することで、活性部位のプロトン放出基 (prototropic groups) の pK 値 を知ることができます。
• pK 値の範囲がわかると、活性部位の構造 (コンフォメーション) 、基質結合、または、反応の触媒作用に関わるプロトン放出基の状態を、一般に公開されている通常のプロトン放出基の値と比較することによって決定することができます。
• 基質にイオン化できる解離基が含まれることがあります。
• その場合の基質はイオン交換が限定されることになります。イオン化できる解離基のうち、実際に酵素や触媒と結合する可能性があるのは単一基質のイオン形のみです。

使用可能なグラフ

• y vs. pH
• log(y) vs. pH
• Residual Graphs