4.14.26 Surrounding Hydrophobicity

この移動窓 (sliding window) 解析は、Manavalan & Ponnuswamy の論文のデータに基づくものです [Nature 275:673 (1978)] 。このデータは任意のアミノ酸が疎水性アミノ酸で包囲される尤度 (likelihood) を示したものです。論文中の Table1, col2 の値は、著者が示唆するようにグルタミンに標準化 (“standardized”) されています。この解析は、Hydropathy 解析で Manavalan & Ponnuswamy テーブルを使用したのと同じです。