アカデミア創薬の効率化のための電子実験ノートシステム (E-Notebook)
	大阪大学大学院薬学研究科 附属創薬センター　構造展開ユニット 駒川 晋輔　特任助教 春田 純一　特任教授

 

知財や論文作成時、様々なノートからデータを収集する必要があるときに、電子実験ノートシステムは強力なツールとなります。

 

現在研究されている内容について教えてください

「構造展開ユニット (Lead Exploration Units: LEU)」では、製薬企業出身・出向者の知識・経験を活用したアドバイスや、テーマの具現化に向けた相談、ヒット化合物の合成展開など、創薬の包括的な支援を行っています。また、化合物の初期薬物動態評価として、物性・代謝安定性・膜透過性・タンパク結合率などの in vitro ADME 評価、および iPS 細胞由来心筋細胞を用いた心毒性評価の実施が可能です。現在、AMED「生命科学・創薬研究支援基盤事業」の採択を受け、「創薬等先端技術支援基盤プラットフォーム (BINDS)」と連携して、基礎研究の推進とその研究成果を創薬研究などの実用化研究に繋げることを目的とした公的研究支援を行っています。

実験室

 

電子実験ノートシステム (E-Notebook) をどのような場面で使用されていますか?

実験情報や合成化合物の管理、研究者間の情報共有に電子実験ノートシステムは役立てています。実験ノート作成は化学構造式や試薬データベースから入力できるため簡単に行うことができ、反応式は実験化学者が使い慣れている ChemDraw 形式なので効率よく描画できます。反応式に記載すれば分子量は自動計算され、試薬量も当量計算されるので、手計算の必要がなくミスを減らせています。用いる試薬や合成化合物は CRAIS Checker による法規制チェックを実施しており、実験前に法規制情報の確認ができています。ノートはテキスト情報だけでなく、画像や Office ソフト、PDF なども組み込めるので、NMR や LCMS などの情報もひも付け可能です。実験ノートは変更履歴や電子承認により知財への対応にも役立っています。

E-Notebook 使用例

合成化合物は E-Notebook 上で登録すると自動的に発番されるため、化合物番号、ロット番号、塩情報などを一元管理できます。登録化合物リストは SDF で外部出力することもでき、外部のデータベース管理ソフトと連携した管理も行えます。当ユニットでは合成化合物の in vitro ADME 評価を同時に行っており、化合物情報と統合して管理しています。

 

電子実験ノートシステム (E-Notebook) を使い始めたきっかけは?

現代の研究現場では業務の効率化や情報の管理が必須であり、ほとんどの製薬企業で電子実験ノートを利用しています。当ユニットでは製薬企業出身・出向者が在籍しており、製薬企業の現場と遜色ない環境で実験できるようにするため導入しました。

 

電子実験ノートシステム (E-Notebook) の魅力とは?

実験ノートを電子化するメリットは、自分や他者の過去の実験を簡単に確認することができる点です。E-Notebook には検索機能も付いているので、実験者やノート番号だけでなく、キーワードや構造式からも検索でき、さらにノートをコピーして再利用することもできるので、目的の実験の再現や類似実験を楽に行えます。またフォーマットが決まっているので、難読で困ることもありません。特に知財や論文作成時、様々なノートからデータを収集する必要があるときに、電子実験ノートシステムは強力なツールとなります。

E-Notebook 検索例

 

今後の展望 / 製品機能への要望

大阪大学薬学研究科では自動合成装置を導入しており、E-Notebook の Parallel Synthesis の機能を活用したパラレル合成の自動化を目指しています。Parallel Synthesis は置換基変換など類似化合物を数多く作る際に便利な機能ですが、Chem ACX (試薬データベース) との連携ができなかったり、複数回 CRAIS Checker (法規制チェック) を行わなければならないなど、不便なところが解決されると良いかと思います。

自動合成装置

 

 

 

本事例作成に関し、駒川先生のご協力に感謝いたします。

（インタビュー：2024 年 9 月）

※所属・役職は取材当時のものです。

関連リンク

• 大阪大学　創薬サイエンス研究支援拠点