一般的なフラグメントの EFP ライブラリ
EFP Library of Common Fragments
- 開発者: Dmytro Kosenkov と Lyudmila Slipchenko
Lyudmila Slipchenko
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Dmytro Kosenkov
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Q-Chem は EFP ジョブのセットアップを簡単にする計算済みパラメータの付いたユーザーフレンドリーな標準 EFP フラグメント用ライブラリを提供します。このライブラリには、一般的な有機溶媒と DNA 塩基に有効なパラメータが用意されており、フラグメントの件数は今後定期的に更新される予定です。
ライブラリに含まれる EFP フラグメント。各フラグメントのライブラリファイルには、原子座標、多重極展開点の座標、多重極モーメントの分布 (最大で八重極)、静電遮蔽パラメータ、LMO セントロイドの座標、LMO (局在分子軌道) セントロイドにおける静的および動的な分極率テンソル、波動関数と Fock 行列要素、および EF 原子の原子ラベルが含まれます。
論文:
- D. Ghosh, D. Kosenkov, V. Vanovschi, C. Williams, J. Herbert, M. Gordon, M. Schmidt, L. Slipchenko, A. Krylov, "Noncovalent Interactions in Extended Systems Described by the Effective Fragment Potential Method: Theory and Application to Nucleobase Oligomers” J. Phys. Chem. A, 2010, 114 (48), pp 12739–12754
Q-Chem 4.0 マニュアル: