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更新日: 14/03/17

4. 関連する複数のシーケンスを解析し、その全ての出力結果を単一の出力オブジェクトとして表示する方法はありませんか?シーケンスのグループを同時に表示させて、そこから次にどの解析を実行すべきかを判断したいのです。

Gene Inspector では、複数シーケンスに対して一度に "Summary Analyses" と呼ばれる解析を実行し、その結果を単一のサマリー出力オブジェクトとして表示させることができます。これによって得られた出力オブジェクトから、個々のシーケンス解析に含まれる詳細な結果を調べることができます。Summary Analyses は、Gene Inspector が提供する全ての解析で実行できるわけではありません。この表示タイプが最もふさわしい解析でのみ利用することができます。例えば、異なる生物種に由来する関連するシーケンスのセットの中から共通するヌクレオチドシーケンスを同定するような場合がこれに相当します。

"Analysis Setup" パネルの中にある、右下のチェックボックスで "Show summary results" を選択します。シーケンスを追加したら通常どおり解析を実行します。解析が完了したらノートブックウィンドウに "summary result object" が表示されます。このオブジェクトには、解析対象となった全てのシーケンスが一覧で表示され、次に行う解析の出発点の役割を果たす解析の概要がグラフィックで表示されます。セットアップパネルで "Summary Analysis" オプションを使用しなかった場合は、結果は個別の解析出力オブジェクトとして表示されます。

さらに、このサマリーから任意の解析を一つ選び、メニューから "Object > Show Info ..."を選択することで、選択したシーケンスに対して詳細な (単一シーケンスの) 解析を起動することができます。この解析結果は、GI ノートブックの新規オブジェクトとして表示されることになります。

Summary Analyses に関する詳しい説明は、GI マニュアルのチュートリアル6をご覧ください。

 

 

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