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QuantiScan は、ポリアクリルアミドゲル電気泳動やアガロースゲル電気泳動により得られた結果の画像をスキャナなどで読み込み、バンドの濃さをグラフ化、数値化するソフトウェアです。レーンおよびピークの自動認識、ガウス関数によるカーブフィッティングにより、ピーク位置やピーク面積を算出することもできます。もちろん、分子量マーカーを流したレーンを指定して、ピーク位置を分子量に換算することも可能です。画像の取り込みは、TIFF または BMP ファイルに対応しているほか、クリップボードからのペーストも可能です。カラー画像のグレースケールへの変換、回転、バックグランドの除去、グレースケールの反転等、前処理のための機能も含まれています。
バックグランドの除去に関しては、以下の4つのオプションがあります:
レーンがセットされると、ピークの中心と幅の指定は、手動またはピーク検索機能により、簡単に指定することができます。ガウス曲線でカーブフィッティングを行うことも可能です。
ピークの位置、高さ、幅、バックグラウンド、面積を含む全てのパラメータに関するレポートを作成することができます。ピークの面積は、シンプソン則(Simpson’s rule)による積分によって計算されます。分子量マーカーを流したレーンを基準に他のレーンのピーク位置を分子量へ自動的に換算させることも可能です。
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