HyperProtein は、分子モデリングとバイオインフォマティクスの２つの機能を組み合わせた Hypercube 社の全く新しいタンパク質解析ツールです。HyperProtein には、タンパク質モデリングに必要な HyperChem の機能に加え、配列アライメントやタンパク質ファミリーの系統樹作成といった HyperProtein 独自の機能が装備されています。配列を操作できる製品は他にもありますが、本製品ではそうした機能の大部分がマルチウィンドウのグラフィカル・ユーザーインターフェースで互いに強固に結びつけられており、これによって、配列の一次元情報をタンパク質の三次元構造と関連付けすることができるようになります。バイオインフォマティクスと分子モデリングの各種機能を単一のソフトウェアに組み込み、これらをグラフィカルに操作できるのは HyperProtein のユニークな特徴です。

HyperProtein の特徴：

• 多重配列アライメント (MSA)
• プロファイル・アライメント
• 祖先型配列の作成
• 系統樹の作成と表示
• 系統樹の立体構造へのマッピング
• 配列とマッピングの多彩な色分け
• Perl と TCL スクリプトをサポート
• 優れたプロジェクト機能及び複数ウィンドウ操作
• 二次構造の予測
• ホモロジー
• 多重配列アライメント属性の立体構造へのマッピング