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ケミカル・バイオ分野で役立つソフトウェアのご紹介

CambridgeSoft Chem&Bio シリーズ

  • ChemBioOffice
    ChemBioOffice は、化学・バイオ分野で必要とされる様々なツールを 1つにまとめた統合化学ソフトウェアパッケージです。化学を専門とするユーザーには欠かすことのできない構造描画ツール (ChemBioDraw Ultra)、立体構造の描画と各種計算プログラムのクライアントツール (ChemBio3D Ultra)、電子ノートブック (E-Notebook)、化学構造式を含むデータベース構築ツール(ChemFinder)、また試薬カタログなど各種データベースが装備されます。

  • ChemBioDraw
    ChemBioDraw Ultra は化学構造式と生物学パスウェイを描画するプロフェッショナルのための総合ツールです。高度な予測ツールを備えているほか、ChemBioDraw ActiveX/Plugin を使用することでウェブとの完全な統合を実現することもできます。

  • ChemBio3D
    ChemBio3D は、蛋白質構造、分子表面、分子軌道、分子静電位、電荷密度、およびスピン密度を視覚化して表示するための最新機能を備えています。3D 分子オーバーレイや二面角ドライバなどの基本的な計算ツールを装備。オプションで、MOPAC、Jaguar、Gaussian、GAMESS、拡張 Hückel を使用して分子特性を計算することもできます。

バイオ関連ソフト (Biosoft)

一般科学

  • FigSys
    FigSys は、実験データの処理・分析・プレゼンテーションから各種学術論文の作成までをひとつでこなす多機能グラフ作成ソフトウェアです。酵素反応解析に役立つミカエリスメンテン、リガンド結合等の関数が標準装備されています。

  • Ungraph
    報告書や学術論文といった出版・印刷物や、計測器で出力されたチャートに描かれているグラフの元になった XY データを手軽に数値化することができたらと思ったことはありませんか?UnGraph を使えば、紙に描かれたグラフをスキャナでスキャンしたり、デジタルカメラで撮影することでグラフの正確な座標をデータとして取り込むことができます。

  • Stat-200
    Stat-200 は、統合的な統計解析ソフトウェアです。記述統計のすべてと、パラメトリック・ノンパラメトリック検定、グラフ作成、データ変換、データの解析およびプレゼンテーションといったおよそ統計解析に必要な機能すべてを備えています。

生物医学

  • AssayZap
    AssayZap は、RIA、ELISA、IRMA、比色法など各種測定データのアッセイに役立つ汎用計算ツールです。最大 2^31 までのデータを取り扱うことができます。標準曲線のフィッティングには、2-パラメータ、4-パラメータ、重み付き 4-パラメータを選択できます。

  • CalcuSyn
    CalcuSyn Version 2.0 は、薬の組み合わせによって生ずる相乗効果や抑制効果といった現象を自動的に定量化できる、薬物併用効果分析ツールです。CalcuSyn は、T-C Chou と P. Talalay によって報告された Median Effect 法 (Trends Pharmacol. Sci. 4, 450-454) にもとづいて複数薬物の用量と効果(dose-effect)を計算します。

  • EnzFitter
    EnzFitter は、酵素反応速度の実験データ解析に役立つ特別な機能を備えた汎用カーブフィッティング・パッケージです。1および2基質の速度データについて、初速度とパラメータ値を信頼限界と共に得ることができます。ビルトインモデルには、基質阻害、競争阻害、非競争阻害、混合阻害のある場合とない場合の Michaelis-Menten、基質による阻害がある場合とない場合の三成分すなわち ordered bi-bi 機構と Ping-pong 機構が含まれます。

  • Kell
    KELL は、放射性リガンド結合を分析する基本的ソフトウェアです。これまでに世界中の数千もの研究室で活用されており、学術論文中で最も引用数の多いソフトウェアのひとつです。

  • QuantiScan
    QuantiScan は、ポリアクリルアミドゲルやアガロースゲル電気泳動のゲル等をスキャナ (TWAIN 対応) で読み込み、バンドの濃さをグラフ化、数値化するソフトウェアです。レーンおよびピークの自動認識、ガウス関数によるカーブフィッティングにより、ピーク位置やピーク面積を算出することができます。

学習・教育

  • CardioLab
    CardioLab は、麻酔や脊髄破壊を施した実験動物の心拍数と血圧を再現する薬理作用シミュレーションソフトウェアです。

  • Ileum
    Ileum は、モルモットの摘出回腸を用いた薬効試験を PC 上で正確にシミュレーションするソフトウェアです。

  • NeuroneSimulator
    NeuroneSimulator は、主に大学生と大学院初等レベルの教材として最適な神経生理学シミュレーションプログラムです。

薬品管理システム

  • STORAGE4
    STORAGE4 は、各研究所および施設全体の薬品管理を一元化することで、薬品の購入から廃棄までの使用履歴を把握し、入庫・出庫・補充・廃棄時の量を時系列的に管理する WEB ベースのシステムです。法規管理や在庫、棚卸などの効率化が図れ、また CS ChemOffice Enterprise との連携で化学構造式検索を実現いたします。

結晶構造

  • Crystal Studio
    Crystal Studio ver.9 は、化学、材料科学、固体物理学、鉱物学、地質学、X 線結晶構造解析、電子顕微鏡分野の研究や教育を支援する Windows 98/ME/2000/XP/Vista 対応 結晶構造解析ソフトウェアです。操作性の高いモデル作成ツールと、3D によるグラフィカルデザイン・表示・操作機能、回折パターンのシミュレーションエンジンを備えた強力なツールです。結晶構造データ・ベースを活用すれば、わずか数クリックで高度なグラフィックと回折パターンを作成できます。

  • CrystalMaker
    CrystalMaker は、海外各誌で賞を獲得した結晶構造および分子構造の構築と表示そして多彩な機能を備えた結晶・分子構造設計プログラムです。CrystalDiffract (無償のデモバージョンをご利用可能) を使えば、画面に表示された結晶からメニューコマンド一つで X 線又は中性子粉末回折パターンを生成できます。リアルタイムの傾斜コントロール、距離と角度の表示、位相情報のカラー表示機能を備えた新しい SingleCrystal プログラムを使えば、単結晶回折パターンと逆格子セクションを可視化することができます。

  • ATOMS
    ATOMS は、結晶、高分子、分子等さまざまなタイプの原子構造を描画するプログラムです。最新システムを使用したフル三次元カラー描画から、印刷用のシンプルなモノクロの図まで、さまざまな用途にあわせてご利用いただけます。最新バージョン 6.3 Mac 版では、PowerPC および Intel Mac にネイティブ対応しています。

  • SHAPE
    SHAPE は、単結晶、双晶およびエピタキシャルやその他の連晶の形態と対称性を計算し表示するプログラムです。プログラムの基礎をなす数学的理論は、The American Mineralogist (1980, V65, p.645) に論文が発表されており、以来、プログラムの性能とスピードに関して多数の改良が進んでいます。最新バージョン 7.2 Mac 版では、PowerPC および Intel Mac にネイティブ対応しています。

  • Vibratz
    VIBRATZ は、原子価力定数や Urey-Bradley 力場定数を利用して、あらゆる分子や結晶の基準座標計算をするプログラムです。最新バージョン 2.1 Mac 版では、PowerPC および Intel Mac にネイティブ対応しています。

  • MacTempasX
    MacTempasX は、MacTempas のメジャーアップグレードです。プログラムには、新しい機能が豊富に追加されています。基本機能の HRTEM (高分解能透過電子顕微鏡) の画像/回折シミュレーション機能に加え、STEM (走査型透過電子顕微鏡) および CBED (収束電子回折) 計算機能が装備されています。画像の定量的な比較や構造精密化はもちろん、画像処理についても MacTempas の基本機能に加え拡張機能が備わっています。

  • CrystalKitX
    CrystalKitX はあらゆるタイプの結晶体(数千の原子を含む幾何学的な粒界や積出物等)でも粒子間の結合関係や接触面、軸等を設定すれば、非常に短時間で作成することができる MacOS X 用結晶構造作成ソフトです。結晶体構造は、MacTempasX のストラクチャーファイルとして書き出すことができます。

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